El Programa de Posgrado en Humanidades, Derechos y Otras Legitimidades (PPGHDL) tiene importantes alianzas con organismos públicos, como el Ministerio de Justicia y Seguridad Pública, el Ministerio de Educación y el Ministerio de Derechos Humanos y Ciudadanía de Brasil; la Municipalidad de São Paulo, la Secretaría Municipal de Derechos Humanos y Ciudadanía de São Paulo, la Secretaría Municipal de Educación de São Paulo; y la Secretaría de Estado de Justicia y Ciudadanía del Estado de São Paulo, entre otros. Además, varios proyectos reciben reconocimiento y apoyo de la ONU.
Las alianzas, que se implementan a través de investigación, acciones concretas y apoyo al desarrollo de políticas en educación, cultura y derechos humanos, incluida la lucha contra el racismo, la xenofobia y la LGBTQIA+fobia, incluyen investigación, educación, cultura y acciones sociales, como Bibli-ASPA (que desarrolla proyectos por/para/con refugiados, apátridas, inmigrantes, personas sin hogar, educación antirracista desde hace más de 20 años), Educafro, Minas programas y el Centro Cultural Mayegun, entre otros.
Además, son importantes las alianzas con movimientos sociales y educativos y también con otras instituciones de la USP, como el Centro de Estudios de las Literaturas y Culturas de la Lengua Portuguesa (CELP/USP), NAP como el Centro de Apoyo a la Investigación (NAP) Diversitas y el Brasil Centro de Apoyo a la Investigación en África (NAP) (que reúne a africanistas de la universidad), el Grupo de Diálogo Intercultural del Instituto de Estudios Avanzados (AIE/USP), entre otros.
